Usualmente la mayoría de los quistes no producen síntomas, salvo la presencia de una protuberancia palpable, indolora. Dependiendo de su localización y sobre todo de las puede presentar otros síntomas, sobre todo si estos se presentan en el interior del cuerpo, afectando la cavidad abdominal u órganos como el hígado o los pulmones, es en estos casos que producirían una variedad de síntomas como dificultad para respirar, dolor abdominal, entre otros.