Según lo que comentas la probabilidad de que estés en embarazo es muy baja, teniendo en cuenta que te realizaste la prueba de embarazo en el tiempo adecuado y el resultado fue negativo (las pruebas de embarazo en orina son confiables luego de 20 días de la relación sexual de riesgo), es probable que tu retraso en el sangrado menstrual y tus síntomas se deban a otras causas que originan estos trastornos del ciclo, como por ejemplo:
Te aconsejo que para tu tranquilidad, te realices otra prueba de embarazo y en caso que continúe siendo negativa, asistas a la consulta médica con ginecología, para que recibas una valoración médica a fondo y se puedan estudiar las causas de tu retraso menstrual.