Si, Si es el mismo.
La infección por Neisseria Gonorrheae (Gonorrhea) es la misma en todo el cuerpo, sólo que puede producir diferentes síntomas, algunos están confinados a los genitales, mientras que otros a la piel o la boca, sin embargo es la misma infección, y requiere el mismo tratamiento.
Espero haberte ayudado y estaré atento si tienes más dudas para poder orientarte.