¿El tener malestar estomacal se puede deber al Aciclovir y a la Prednisolona que me recetaron porque tengo Herpes Zoster en el pecho? 

Así es, lo que se puede hacer es complementar este tratamiento con Omeprazol, una vez en las mañanas en ayunas, y si la acidez es muy persistente se puede tomar cada 12 horas hasta completar el tratamiento del Herpes.